राज्य में जेएमबी, अलकायदा एवं अंसारुल्लाह बांग्ला टीम जैसे खूंखार आतंकी संगठन पूर्वोत्तर क्षेत्र खासकर असम में अपनी गतिविधियां बढ़ाने के लिए सक्रिय हैं। खासकर अलकायदा से संबद्ध अंसारूल्लाह बांग्ला टीम यहां अपनी जड़ को मजबूत करने में लगी हुई है। कई बार इन संगठनों की तरफ से भड़काऊ बयान भी आते रहते हैं। असम पुलिस विगत एक सप्ताह से राज्य में सक्रिय जिहादी मड्यूलर को ध्वस्त करने के लिए सिलसिलेवार रूप से अभियान चला रही है। इस दौरान बरपेटा, मोरीगांव और गुवाहाटी से कुल 11 संदिग्धों को गिरफ्तार तथा कई लोगों को हिरासत में लिए गए। एनआईए सहित असम पुलिस की एक विशेष टीम जिहादियों का हॉटस्पाट बरपेटा जिले में डेरा डाली हुई है।